冠状病毒时期的HPC

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作者:helenrtang

2020年突然变成了冠状病毒之年。为了减缓传播速度,拯救生命,抑制这种可怕病毒对经济的影响,政府、医学专家和科研机构正夜以继日制定计划、落实行动。此时,速度是关键——HPC正在为人类加速。

以下介绍的公司正奋战于这场新型生物战的前线:

 默克(Merck):战胜冠状病毒的一个关键策略是开发一种有效的疫苗。默克(Merck)等制药公司正带头冲锋,不惜一切代价,力求在几个月内研制出疫苗。即使在中国,这个曾经受病毒危害最严重的国家,默克公司的4000名员工已经重返工作岗位。

 HPC在行动:疫苗研究会产生大量数据集合。电子显微镜及其他技术被用来可视化和验证候选疫苗,相关数据存储于大型数据库中,而样本疫苗的结构需要以接近原子级别的分辨率来显示,这对并行计算能力提出了极高的要求。而这也正是高性能计算(HPC)的优势所在,其在疫苗研究领域中作用显著。

 罗氏(Roche):罗氏集团在对抗冠状病毒的战斗中发挥着重要作用,主要体现在两个极为关键的方面。一是检测,作为诊断学领域的领导者,罗氏集团及其旗下的工厂正夜以继日地生产冠状病毒检测试剂盒,并与受该病毒影响国家的卫生部门合作,确保人们能够获得检测机会。其刚刚推出了一项新的检测方法,比原有方法的检测速度快10倍,一个检测单元一天可以检测数千个样本。经美国食品和药物管理局(FDA)批准后,罗氏集团将每周向美国运送40万份。二是其抗炎药物Actemra的新应用,中国已经批准使用该药物来治疗晚期冠状病毒患者严重的肺损伤。自从10年前美国食品和药物管理局批准Actemra上市后,其就成为对抗某些炎症的首选药物。针对COVID-19,人们希望它可以帮助阻止身体对感染的过度反应,以及阻止病毒对肺部和其他器官的攻击。

 HPC在行动:通过将超级计算与人类基因组计划相结合,HPC现已成为几乎所有药物研发过程中的核心突破口。实验室研究人员创建了人类疾病进展和药物反应的数据驱动模型,用于运行模拟以帮助发现新的候选药物。巨大的计算能力帮助像罗氏这样的公司指导研究方向,并最终选择药物来改善患者的治疗成效。

 马克斯-普朗克研究所(Max Planck Institute):马克斯-普朗克学会致力于支持自然、生命和社会科学的基础研究。其涉及的一些生命科学研究涵盖了从生物结构到神经回路,从病毒学到药物研发的一切。随着COVID-19传染病在全球的蔓延,马克斯-普朗克研究所最近与欧洲5个最大的国家科学研究组织合作,呼吁建立长效机制资助与病毒感染相关的生物学、经济学和社会学研究。

 HPC在行动:大数据时代为HPC展示其巨大的社会和经济影响力,提供了绝佳的机会。HPC不仅可以在生物学、经济学和社会学等不同的科学领域实现复杂的应用,还可以跨越边界,将所有这些应用整合到新的模型中,并将数以千计的复杂因素考虑其中。人工智能和机器学习在这一领域也有新的应用,打破障碍、实现整体研究的前景就在眼前。

以上仅列举了部分组织在帮助人类阻止COVID-19蔓延中做出的努力。您知道他们还有什么其他共同点吗?都是SUSE的客户!没错,SUSE在High Performance Computing方面有着可靠的业绩。事实上,全球排名前50位的超级计算机中有21台运行着SUSE,在排名前100位的超级计算机中SUSE占有53%的份额。从这个角度来说,SUSE也正在为全球抗疫坚守岗位

为了将HPC解决方案用于解决人类最棘手的问题,SUSE与许多行业巨头合作密切,包括:

  • AMD
  • Arm
  • 戴尔
  • 富士通
  • HPE/Cray/SGI
  • 英特尔
  • 联想
  • Marvell
  • NVIDIA
  • 了解更多合作方信息,请单击此处

就职于SUSE联盟营销部门(SUSE Alliance Marketing),我了解到许多关于戴尔“HPC就绪解决方案”的配置信息,其为客户提供了一系列选项,非常适合各种规模的组织机构,还提供特制服务器、存储单元和工作站以满足各类使用实例。其中的诸多设计选择,将有助于加快部署和扩展,以满足您独特的HPC需求。

让我们携手共进,用high performance computing打造更美好的明天。祝您平安、健康!

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